Saison 3 (1999)
1 - Bébés volés
7 octobre 1999L'enquête d'Isabelle Florent l'amène jusqu'en Guadeloupe où, elle enquête sur un trafic de bébés volés. Accompagnée de son fils Nicolas, elle retrouve son ex-compagnon, Hervé, le père de Nicolas.
2 - Coupable idéal
4 novembre 1999Conduit à l'enterrement de sa mère un détenu réussit à s'enfuir. Ancien bûcheron, il s'enfonce dans une grande forêt qu'il connait bien, où un meurtre a été commis il y a 12 ans. En parallèle, Cluzeau enquête sur une bande de jeunes tagueurs. C'est dans cet épisode qu'apparaît le capitaine Kremen.
3 - La Femme battue
2 mars 2000Accusé de dénaturer sa production, un vieux vigneron prend en otage un inspecteur des fraudes avant de mettre fin à ses jours. Isabelle, en allant chercher Nicolas à une fête, croise une femme battue. L'affaire ce complique lorsque l'époux de celle-ci, l'inspecteur des fraudes, est retrouvé mort.
4 - Son et lumière
18 mai 2000Christian et Nathalie Vincenti, des éducateurs, se consacrent à la réinsertion de jeunes délinquants, au château de Saint-Fargeau. Ces jeunes sont d'autant plus mal acceptés que des cambriolages ont été commis dans les environs.
5 - Mort clinique
7 septembre 2000Léa Perez, une jeune femme, est retrouvée morte dans un cabanon après y avoir passé la nuit avec le gendarme Cluzeau