Saison 2 (2016)
C'est une rentrée très spéciale qui commence, car à la fin de cette année scolaire, Koro-sensei détruira le monde si les élèves de 3E ne le tuent pas avant.
1 - Leçon 1 : Festival d'été
8 janvier 2016Le voyage d'été de la classe 3E dans l'île touche à sa fin et Koro-sensei organise un test de courage pour tenter de créer quelques couples parmi ses élèves.
2 - Leçon 2 : Kaede
15 janvier 2016Quand Kaede imagine un plan pour tuer Koro-sensei avec un énorme pudding explosif, toute la classe l'aide à le fabriquer.
3 - Leçon 3 : Itona Horibe
22 janvier 2016Itona attaque de nouveau Koro-sensei, mais celui-ci le repousse facilement et ses implants de tentacules échouent. Quand Shiro l'abandonne, Itona pique une grosse colère.
4 - Leçon 4 : Tissage
29 janvier 2016Grâce à son talent en électronique, Itona construit un gadget téléguidé pour attaquer Koro-sensei, mais les autres garçons veulent l'utiliser à des fins plus légères.
5 - Leçon 5 : Leader
5 février 2016Asano découvre que le président de la classe 3E travaille à temps partiel et accepte de ne pas le dénoncer à une condition : les 3E doivent gagner un match contre les 3A.
6 - Leçon 6 : Avant et après
12 février 2016Quand un raccourci mal négocié emmène un vieil enseignant à l’hôpital, Koro-sensei donne aux élèves à réfléchir sur leurs actes en gérant les petits écoliers du blessé.
7 - Leçon 7 : Dieu de la mort, 1re partie
19 février 2016Jouant les Cupidon, les élèves se débrouillent pour que Karasuma offre des fleurs à Irina. Mais celui-ci insulte Irina, et elle ne vient plus à l'école.
8 - Leçon 8 : Dieu de la mort, 2e partie
26 février 2016Karasuma et Koro-sensei tentent de sauver les élèves, mais quand le professeur est capturé par le Dieu de la mort, Karasuma et Irina font face à un choix difficile.
9 - Leçon 9 : New game +
4 mars 2016C'est le moment de faire des projets de carrière. Alors que sa mère veut le retirer de la classe 3E, Nagisa se demande s'il désire vraiment être un assassin.
10 - Leçon 10 : La fête de l'école
11 mars 2016Lors de la fête du collège Kunugigaoka, un concours permet de lever des fonds. 3E sert des plats cuisinés avec des ingrédients de montagne, mais 3A ne recule devant rien.
11 - Leçon 11 : Fin de trimestre, 2e heure
18 mars 2016Les examens finaux arrivent rapidement et tandis que les 3A subissent un vrai lavage de cerveau pour haïr les 3E, Gakushu demande aux 3E de faire mieux que les 3A.
12 - Leçon 12 : Espace
25 mars 2016Lors de l'examen final, Karma et Gakushu rivalisent pour résoudre un difficile problème de maths. Et maintenant, c'est l'heure des résultats...
13 - Leçon 13 : Laisser vivre
1 avril 2016Koro-sensei déjoue le plan majeur conçu par Asano pour l'assassiner, laissant à celui-ci le dernier manuel scolaire et ses réflexions sur sa propre carrière d'enseignant.
14 - Leçon 14 : Véritable identité
8 avril 2016Alors qu'ils nettoient le cabanon, Kaede attaque Koro-sensei, révélant un lien surprenant avec l'ancien professeur de la classe E, Aguri Yukimura.
15 - Leçon 15 : Confessions
22 avril 2016La furie de Kaede va la tuer si Koro-sensei et les autres élèves n'interviennent pas immédiatement. Surprenant ses camarades, Nagisa tente le tout pour le tout.
16 - Leçon 16 : Passé
29 avril 2016Leur captivité dans le laboratoire de Yanagisawa a rapproché émotionnellement le Dieu de la mort et Aguri Yukimura. Mais l'une des souris de Yanagisawa fait tout déraper.
17 - Leçon 17 : Scission
6 mai 2016Nagisa veut sauver Koro-sensei, mais la classe ne parvient pas à un consensus. Koro-sensei suggère de résoudre le conflit dans un match de paintball.
18 - Leçon 18 : Résultat
13 mai 2016Au terme du match de paintball, Karma et Nagisa restent seuls sur le terrain. Karma défie alors Nagisa en un duel ultime.
19 - Leçon 19 : Espace
20 mai 2016Aidés par leur classe, Nagisa, Karma et Ritsu se faufilent dans la fusée pour la Station spatiale internationale afin de trouver les données requises par Koro-sensei.
20 - Leçon 20 : Saint-Valentin
27 mai 2016Les examens d'entrée au lycée et la Saint-Valentin approchent. Après avoir parlé avec Sakura, Nagisa envisage de faire carrière dans l'enseignement.
21 - Leçon 21 : Confiance
3 juin 2016Koro-sensei décide de réaliser un album de fin d'année en utilisant ses propres photos. Alors que le temps presse, Nagisa évoque son projet d'enseignement avec lui.
22 - Leçon 22 : Joyeux anniversaire
10 juin 2016Il ne reste plus que trois heures avant le chargement complet du laser. Les élèves lancent une ultime mission d'infiltration pour sauver Koro-sensei.
23 - Leçon 23 : Boss de fin
17 juin 2016Le Dieu de la mort continue d'attaquer Koro-sensei avec Yanagisawa qui s'en prend maintenant aux élèves. Karasuma tente alors d'intervenir.
24 - Leçon 24 : Fin de scolarité
24 juin 2016Si Kaede a survécu, Koro-sensei est très affaibli. Quand il exprime une dernière requête, les élèves de la classe 3E doivent décider d'honorer sa volonté ou pas.
25 - Leçon 25 : Avenir
1 juillet 2016La classe 3E assiste à la cérémonie de départ de Kunugigaoka. Avant la dispersion générale, Nagisa apprend que Koro-sensei lui a fait une dernière faveur.