1 - Le requin-baleine

Lorsque Peso est avalé par un requin baleine, les Octonautes s'aventurent à l'intérieur à son secours.

2 - La tempète sous-marine

Kwazii accidente le Gup-B en essayant d'échapper à une tempête. Lors du sauvetage par le Gup-C, la corde de remorquage casse. Quelques homards des récifs que Kwazii avait permis d'atteindre un abri viennent prêter main forte.

3 - Le crabe et l'oursin

Les escargots de mer se plaignent d'une étrange créature avec des pinces et des piques.

4 - Le chef morse

Le capitaine Barnacles et Kwazii se déguisent en morse pour récupérer la trousse médicale volée de Peso.

5 - Les poissons volants

6 - Le calamar géant

7 - Les orques

8 - Les algues proliférantes

9 - Les rémipèdes

10 - Les espadons voiliers

11 - Les frères Bob

12 - Le monstre marin

13 - L'étoile de mer

14 - La baleine à bosse albinos

15 - La forêt de varech

16 - Les anémones de mer

17 - Boris le narval

18 - La zone de minuit

19 - La crevette géante

20 - Le concombre de mer

21 - Le tourbillon géant

22 - Les bernard-l'hermite

23 - La baleine désorientée

24 - Le sauvetage dans la forêt de varech

25 - Le crabe décorateur

26 - Les dauphins blancs

27 - Le poisson pilote

28 - Le vampire des abysses

29 - Les hippocampes

30 - Le comb-jelly

31 - Les requins-cigares

De mystérieux animaux endommagent le matériel des Octonauts en laissant des empreintes de dents.

32 - Le régalec

Pinto est de passage à l'octocapsule. Il aide les octonauts à retrouver une mystèrieuse créature.

33 - La blennie-dent-de-peigne

Kwazi et Peso ramènent un échantillon d'algues de leur expédition pour Chellington mais ils ont un problème lors du trajet retour vers l'octocapsule.

34 - Les méduses

Une pullulation de méduse envahit les alentours de l'Octocapsule. Chellington ne peut revenir à bord du vaisseau, l'alerte est lancée pour le secourir.

35 - Le bébé dauphin

36 - Booo

Peso soigne un petit concombre de mer, il doit le ramener à sa mère. Après l'avoir déposé avec son Gup, il tombe en panne.

37 - La visite médicale chez les orques

Peso fait passer une visite médicale aux orques mais les orques qui vivent au milieu de la glace.

38 - Les anguilles visqueuses

Les octonauts trouvent l'épave du bateau pirate de Kalikojak, le grand père de Kwazi.

39 - L'éléphant de mer

Peso et Chellington rencontrent un éléphant de mer qui est en train de muer mais il devrait faire sa mue sur la plage où il fait chaud et pas sous l'eau.

40 - Le banc de sardines

Kwazi rencontre Dina une petite sardine. Il lui vient en aide pour retrouver son banc de sardine.

41 - Le récif de corail

Le récif de corail est malade. Peso doit faire des greffes de corail pour que le récif soit à nouveau en bonne santé.

42 - La métamorphose des anguilles

43 - Les iguanes marins des Galapagos

Les Octonauts préparent la fête de l'algue.

44 - Le requin lanterne

Alors que les Octonauts observent un requin baleine, Peso est attiré par une étrange lumière.

45 - Le poisson perroquet

En regardant le portrait de son grand-père le pirate KalikoJack, Kwazi remarque qu'une carte au trésor a été dessinée au dos du portrait.

46 - Les raies électriques

Les Octonauts sont en route pour rendre visite à Sandy la tortue de mer et meilleure amie de Twick.

47 - La seiche

L'octocboussole du capitaine a été perdu par les végéaux à l'extérieur de l'octocapsule.

48 - Le requin-citron

Peso rencontre un requin qui est perdu, de plus il s'est cogné et ses capteurs ne peuvent plus l'orienter.

49 - Le humuhumunukunukuapua'a

Les poissons se précipitent dans l'octocapsule pour se cacher, les Octonauts doivent les faire sortir au plus vite.

50 - Le crabe-araignée géant

Les octonauts arrivent dans les fonds oceaniques du Japon, une région encore inexplorée.