1 - La tempète sous-marine

Kwazii accidente le Gup-B en essayant d'échapper à une tempête. Lors du sauvetage par le Gup-C, la corde de remorquage casse. Quelques homards des récifs que Kwazii avait permis d'atteindre un abri viennent prêter main forte.

2 - Le calamar géant

3 - Les algues proliférantes

4 - Le chef morse

Le capitaine Barnacles et Kwazii se déguisent en morse pour récupérer la trousse médicale volée de Peso.

5 - Les poissons volants

6 - Boris le narval

7 - Le monstre marin

8 - Le crabe et l'oursin

Les escargots de mer se plaignent d'une étrange créature avec des pinces et des piques.

9 - La baleine à bosse albinos

10 - Les rémipèdes

11 - Les orques

12 - Les frères Bob

13 - Le crabe décorateur

14 - Le requin-baleine

Lorsque Peso est avalé par un requin baleine, les Octonautes s'aventurent à l'intérieur à son secours.

15 - Les requins-cigares

De mystérieux animaux endommagent le matériel des Octonauts en laissant des empreintes de dents.

16 - Les méduses

Une pullulation de méduse envahit les alentours de l'Octocapsule. Chellington ne peut revenir à bord du vaisseau, l'alerte est lancée pour le secourir.

17 - Les espadons voiliers

18 - Le vampire des abysses

19 - Le humuhumunukunukuapua'a

Les poissons se précipitent dans l'octocapsule pour se cacher, les Octonauts doivent les faire sortir au plus vite.

20 - Le crabe-araignée géant

Les octonauts arrivent dans les fonds oceaniques du Japon, une région encore inexplorée.

21 - La forêt de varech

22 - Les bernard-l'hermite

23 - Le poisson pilote

24 - Les dauphins blancs

25 - Le concombre de mer

26 - Le tourbillon géant

27 - Les anguilles visqueuses

Les octonauts trouvent l'épave du bateau pirate de Kalikojak, le grand père de Kwazi.

28 - La visite médicale chez les orques

Peso fait passer une visite médicale aux orques mais les orques qui vivent au milieu de la glace.

29 - L'étoile de mer

30 - Le comb-jelly

31 - La crevette géante

32 - Le sauvetage dans la forêt de varech

33 - L'éléphant de mer

Peso et Chellington rencontrent un éléphant de mer qui est en train de muer mais il devrait faire sa mue sur la plage où il fait chaud et pas sous l'eau.

34 - Le banc de sardines

Kwazi rencontre Dina une petite sardine. Il lui vient en aide pour retrouver son banc de sardine.

35 - La métamorphose des anguilles

36 - Le récif de corail

Le récif de corail est malade. Peso doit faire des greffes de corail pour que le récif soit à nouveau en bonne santé.

37 - Le poisson perroquet

En regardant le portrait de son grand-père le pirate KalikoJack, Kwazi remarque qu'une carte au trésor a été dessinée au dos du portrait.

38 - Les raies électriques

Les Octonauts sont en route pour rendre visite à Sandy la tortue de mer et meilleure amie de Twick.

39 - La zone de minuit

40 - La baleine désorientée

41 - Les hippocampes

42 - Les anémones de mer

43 - La seiche

L'octocboussole du capitaine a été perdu par les végéaux à l'extérieur de l'octocapsule.

44 - Le requin-citron

Peso rencontre un requin qui est perdu, de plus il s'est cogné et ses capteurs ne peuvent plus l'orienter.

45 - Le bébé dauphin

46 - Booo

Peso soigne un petit concombre de mer, il doit le ramener à sa mère. Après l'avoir déposé avec son Gup, il tombe en panne.

47 - Le régalec

Pinto est de passage à l'octocapsule. Il aide les octonauts à retrouver une mystèrieuse créature.

48 - La blennie-dent-de-peigne

Kwazi et Peso ramènent un échantillon d'algues de leur expédition pour Chellington mais ils ont un problème lors du trajet retour vers l'octocapsule.

49 - Les iguanes marins des Galapagos

Les Octonauts préparent la fête de l'algue.

50 - Le requin lanterne

Alors que les Octonauts observent un requin baleine, Peso est attiré par une étrange lumière.