Saison 2 (2012)
1 - Bonne année
28 avril 2012L'équipe, désormais constituée de nouveaux membres, doit travailler conjointement avec la Ligue pour s'occuper de ce qui semble être une invasion alien, ce qui les mène également sur une autre planète.
2 - Terriens
5 mai 2012L'équipe Zéta, arrivée sur Rann, infiltre le vaisseau-mère des Krolotéens pour mettre fin à leurs agissements…
3 - Alien
12 mai 2012La Young Justice et la Ligue des Justiciers continuent de débarrasser la Terre des bases krolotéennes ; dans le même temps Miss Martian partage ce qu'elle a découvert sur le vide des 16 heures…
4 - Sauver
19 mai 2012Superboy et Blue Beetle enquêtent sur les derniers agissements de Bruno Mannheim, le chef d'Intergang ; pendant ce temps, Nightwing, Green Arrow et d'autres héros tentent de sauver Red Arrow de son obsession, trouver le véritable Speedy.
5 - Dessous
26 mai 2012Jaime Reyes enquête sur la disparition d'un de ses amis tandis que l'équipe Alpha, composée de Batgirl, Miss Martian, Wondergirl et Bumblebee se rend au Bialya dans le but de trouver la provenance de la bombe extraterrestre fatale aux Krolotéens.
6 - Lignée
2 juin 2012Un mystérieux voyageur venu du futur apparaît à l'intérieur de la base du Mont Justice ; dans le même temps, un nouveau vilain, Neutron, saccage Central City en clamant vouloir tuer Flash…
7 - Profondeurs
9 juin 2012Artemis reprend du service au sein de l'équipe afin d'empêcher la Lumière d'interférer avec le programme spatial…
8 - Satisfaction
29 septembre 2012Roy Harper cherche à se venger de l'homme qui a ruiné sa vie…
9 - Ténèbres
6 octobre 2012Black Manta a une nouvelle mission pour son fils, qui devrait prouver une bonne fois pour toutes de quel côté se place son allégeance !
10 - Avant l'aube
5 janvier 2013Lors d'une mission visant à secourir certains des leurs, l'équipe, Blue Beetle et Miss Martian soulèvent le voile sur de terribles secrets…
11 - Coincé
12 janvier 2013L'équipe se retrouve enfermée dans le Hall de Justice, coincée contre un violent gladiateur alien !
12 - La Nourriture du Futur
19 janvier 2013Lorsque les Reach s'allient avec Lexcorp, Robin décide de mener l'enquête…
13 - La Réparation
26 janvier 2013Black Manta cherche à prendre sa revanche contre Miss Martian…
14 - L'évasion
2 février 2013Nightwing charge Blue Beetle de retrouver les adolescents anciennement détenus par les Reach… Mais Jaime n'est pas le seul à les chercher.
15 - La Guerre
9 février 2013Un conquérant venu d'une autre planète est pris pour cible dans un jeu de poker intergalactique avec les Reach, mettant la Terre en péril…
16 - Complications
16 février 2013Black Manta laisse à Miss Martian seulement 24h à vivre, mais il se pourrait qu'il en reste moins à Aqualad, menacé par Sportsmaster et Cheshire…
17 - La chasse
23 février 2013Un groupe de marginaux est envoyé au combat par Lex Luthor… pour secourir les héros !
18 - Intervention
2 mars 2013L'équipe tente désespérément de libérer Blue Beetle…
19 - Réunion au sommet
9 mars 2013La Lumière réunit un sommet qui va décider du sort d'Aqualad, des héros… et du reste de la planète Terre !
20 - Fin de partie
16 mars 2013Sur le point d'enfin triompher de l'invasion alien, l'équipe découvre que le prix à payer pourrait être la planète Terre elle-même !