Saison 2 (2012)
1 - Orion Pax: Partie 1
18 février 2012Mégatron manipule un Optimus désorienté (perdu sa mémoire suite à l'utilisation de la Matrice) pour qu'il rejoigne les Décepticons.
2 - Orion Pax: Partie 2
25 février 2012Jack trouve le moyen de rendre la mémoire à Optimus: Avec l'aide de la clé pour Vector Sigma sur Cybertron.
3 - Orion Pax: Partie 3
3 mars 2012Optimus se rebelle contre Mégatron pendant que les Autobots tentent de récupérer leur chef via la mission sur Cybertron.
4 - Opération Bumblebee partie 1
10 mars 2012Bumblebee doute de sa place dans l'équipe Autobot après un échec.
5 - Opération Bumblebee partie 2
17 mars 2012Bumblebee découvre que MECH et Starscream sont responsables de ses malheurs et Ratchet affronte ses démons de son passé Cybertronien (Son échec d'avoir pu convenablement réparé les cordes vocales de Bumblebee après que Mégatron l'ait laissé quasi détruit.).
6 - Le Retour de Wheeljack
24 mars 2012Wheeljack revient sur Terre à la recherche d'un Décepticon nommée Dreadwing. Optimus Prime commence à avoir des soupçons sur les réels motifs de Wheeljack de revenir sur Terre.
7 - Trahisons
31 mars 2012Arachnid et Starscream tentent de contrôler un guerrier Insecticon apparu sur Terre.
8 - Nemesis Prime
7 avril 2012M.E.C.H. se crée un clone d'Optimus Prime, nommé Némésis Prime, et le télécommande pour qu'il ravage une base militaire. Naturellement, le vrai Optimus est blâmé pour cette destruction, et l'armée des États-Unis devient hostile. Les Autobots essayent alors de retrouver ce clone et ainsi prouver l'innocence d'Optimus.
9 - Question de confiance
14 avril 2012L'agent Fowler a quelques explications à fournir sous la menace d'un tribunal militaire a propos de la dissolution de l'équipe d'Optimus Prime.
10 - L'Armada
21 avril 2012Bulkhead se retrouve piégé à bord du Nemesis alors que Mégatron est presque deux fois assassiné.
11 - Perte de contrôle
28 avril 2012Lorsque le Nemesis menace l'humanité... Jack, Miko et Rafael sont les seuls qui peuvent y mettre fin.
12 - Aliens dans le métro
5 mai 2012Arcee et Bumblebee affronte Mégatron dans les sous-sols New-yorkais, alors que ce dernier cherche la 4ème relique de Iacon.
13 - La Seconde Relique
12 mai 2012Optimus Prime se rend en Antarctique pour traquer quelques reliques des voûtes de Iacon, mais c'est là qu'il se retrouve pris entre des alliances changeantes.
14 - Virus
19 mai 2012Lors d'une chasse pour une relique, Ratchet et Wheeljack obtiennent une occasion unique en son genre quand le séide volant de Soundwave, Laserbeak, est désactivé.
15 - Energon toxique
26 mai 2012Se déroulant en même temps que les épisodes "Tunnel Vision", "Triangulation" et "triage"... Bulkhead va sur une île volcanique de l'équateur afin de trouver la 4e et dernière relique de Iacon, pour seulement y découvrir qu'il s'agit d'un morceau de Tox-En , une forme d'Énergon hautement toxique. Alors qu'il tente de disposer de la Tox-En en la jetant dans un volcan, il est confronté à un groupe d'Insecticons dirigé par le féroce Hardshell.
16 - Vengeance
24 août 2012Encore sous le choc du combat presque fatale pour Bulkhead contre Hardshell durant la chasse aux reliques, Wheeljack et Miko décide de prendre les choses en mains en traquant Hardshell pour venger Bulkhead.
17 - Coéquipiers
31 août 2012Lorsqu'Arcee se retrouve en compagnie d'un vieil ami inattendu, ensembles ils découvrent un complot secret et élaboré que prépare les Décepticons afin de détruire à jamais les Autobots et revendiquer victoire.
18 - Nouvelle Recrue
7 septembre 2012Pendant que Starscream part à la recherche pour trouver de l'Énergon Rouge, un nouvel Autobot devient membre de l'équipe Prime. Tandis qu'Optimus Prime & Mégatron s'affronte à nouveau dans une bataille épique pour le contrôle de la Terre; les Autobots et les Décepticons trouvent quelques indices qui pourraient faire jouer dans la balance de cette la guerre et peut-être restaurer Cybertron.
19 - L'Homme et la Machine
14 septembre 2012Blessé fatalement, Silas est fusionné par M.E.C.H. avec le corps du Décepticon Breakdown. Maintenant un TF, Silas veut rejoindre les Décepticons et propose à Mégatron le "projet Damoclès", un satellite équipé d'un canon laser, capable de viser sur Terre. Pour contrer cette arme, les Autobots demande l'aide de Raf qui réussit à pirater le système et faire échouer l'attaque du satellite. Mégatron rappelle Silas à revenir au vaisseau et lui ordonne d'être disséquées par Knock Out
20 - Héritage
21 septembre 2012Les Autobots sont leurrés par les Décepticons de l'emplacement réelle d'une relique, l'épée "Star Saber". La relique est enfoncé dans une montagne et ne peut être enlevé que par un chef Autobot, un "Prime". Smokescreen et Jack en équipe, découvre l'emplacement et Ratchet informe les autres. Optimus Prime récupère alors l'épée et envois avec une puissante attaque au vaisseau Décepticon qui prend fuite. Retour à la base, Optimus Prime reçoit alors un message d'Alpha Trion via l'épée "Star Saber".
21 - L'Alpha et Oméga
28 septembre 2012Mégatron essaie d'acquérir la puissance des Primes pour lui-même en déchiffrant les secrets des mystérieuses clés Oméga.
22 - Coup bas
5 octobre 2012Mégatron essaie d'acquérir la puissance des Primes pour lui-même en déchiffrant les secrets des mystérieuses clés Oméga.
23 - La Dernière Clé
12 octobre 2012Smokescreen est capturé puis apprend en même temps l'emplacement de la clé d'Oméga et tente alors de récupérer toutes les autres clés volées.
24 - Réintégration
19 octobre 2012Starscream propose une trêve à Mégatron mais Dreadwing menace de s'interposer sur son chemin.
25 - Retour sur Cybertron
26 octobre 2012La quête pour retrouver les clés d'Oméga amène les Autobots et les Décepticons à retourner sur Cybertron pour s'y battrent.
26 - Le Nouveau Kaon
2 novembre 2012Mégatron met en marche les clés d'Oméga qui commence à faire revivre Cybertron en utilisant l'énergie vitalle de la Terre, qui la transformerait en planète morte, au point qu'Optimus est forcé de détruire les clés d'Oméga, condamnant Cybertron dans le processus. Mégatron lance une attaque de front sur les Autobots, parvenant à trouver leur base et les forces ainsi les Autobots à s'enfuir en solo, afin de mieux se cacher pour une future contre-attaque. Seul Optimus est pris sous les décombent de l'ancienne base Autobot une fois détruite par les Décepticons... est-ce la fin pour Optimus?