Saison 3 (2003)
1 - Sans dessus dessous
12 novembre 2003Un mystérieux personnage a dérobé des gadgets high-tech dans plusieurs laboratoires secrets. Les espionnes sont dépéchées sur place pour mener l'enquête.
2 - La Menace de l'espace
26 octobre 2004Les Spy Girls enquêtent sur la chute inhabituelle de météorites un peu partout sur la Terre. Elles découvrent la responsable : une astrologue jalouse.
3 - Le Café de l'angoisse
27 octobre 2004Un barman, avide de vengeance, fabrique un café qui rend accro celui ou celle qui en boit. Jerry envoie les filles enquêter sur cette affaire.
4 - Cybermaniaque
28 octobre 2004Un concepteur de logiciels a créé un virus informatique qui transforme tous ceux qui y sont exposés en disciples loyaux : les Spy Girls mènent l'enquête.
5 - Disco Spies
29 octobre 2004Les Spy Girls découvrent qu'un malfaiteur a remonté le temps pour persuader Jerry, plus jeune, de créer un WOOHP différent qui répandrait partout le mal.
6 - Le Cirque de la peur
1 novembre 2004En enquêtant sur d'étranges disparitions, les filles découvrent un cirque rempli de créatures extraordinaires et un Monsieur Loyal particulièrement maléfique.
7 - La Menace des gladiateurs
2 novembre 2004Les filles enquêtent sur une princesse riche et puissante, qui kidnappe et enferme des athlètes et des mannequins pour son propre divertissement.
8 - Supernaze
3 novembre 2004Les espionnes doivent trouver le moyen d'arrêter Arnold qui se retrouve en possession d'une pierre magique qui rend ringards tous ceux qu'il croise.
9 - Panique à Beverly High
10 novembre 2004Pour se venger des Spy Girls, un malfaiteur fabrique un robot-morpheur, capable de prendre l'apparence de n'importe quel être humain.
10 - Le Noël de l'angoisse
25 décembre 2004Lors de la fête de Noël au WOOHP, un verre d'alcool est renversé sur l'ordinateur central qui se met à attaquer toutes les personnes présentes.
11 - Super yoga ?
9 mars 2005Les filles enquêtent sur un professeur de yoga en train d'acquérir un popularité exceptionnelle, ses disciples sont apparemment recrutés par la force.
12 - L'effet Musclor
16 mars 2004Des barres vitaminées, créées par un ancien Mister Univers, développent dangereusement les muscles des sportifs qui en consomment. Les espionnes mènent l'enquête.
13 - Y a-t-il un maniaque dans l'avion ?
23 mars 2005Clover gagne un voyage dans un avion rempli de célébrités, mais le pilote s'avère être un malfaiteur fou qui veut rester dans les airs pour toujours.
14 - Panique chez le dentiste
30 mars 2005Un dentiste aigri, qui autrefois connut une renommée mondiale, veut se venger de ceux qui ont ruiné son cabinet en maltraitant la dentition de ses patients.
15 - Les insectes attaquent
6 avril 2005Des installations gouvernementales secrètes sont envahies par des insectes, entraînés par un ancien magnat de la désinsectisation, Max Exterminus.
16 - Révolte au WOOHP
13 avril 2005Les espionnes doivent sauver leur collègue Britney, coincée sur une île qui tient lieu de pénitencier pour les pires criminels que le WOOHP ait arrêtés.
17 - Super Spy
20 avril 2005Alors que Sam et Alex la critiquent sur son manque d'enthousiasme au travail, Clover surprend ses amies lors d'une mission, en éliminant le méchant toute seule.
18 - Le Camp des stars
27 avril 2005Sam, Alex et Clover enquêtent sur une maladie insolite qui a mystérieusement fait perdre leurs talents à de nombreux adolescents.
19 - Action-vérité
4 mai 2005Alors qu'Alex refuse de révéler qui elle préfère, de Sam ou de Clover, un journaliste anglais invente un gaz qui oblige ses victimes à toujours dire la vérité.
20 - L'Esprit d'Halloween
11 mai 2005C'est Halloween et les Spy Girls doivent garder Chucky, un garçon insupportable ; un malfrat profite de l'occasion pour tenter d'éliminer les filles.
21 - Le Laveur de cerveau
18 mai 2005Un scientifique malfaisant a inventé un appareil qui fait rétrécir le cerveau de la population, pour la faire régresser à un stade primitif.
22 - Coup de foudre à haut risque
25 mai 2005Jerry doit se marier avec l'ancienne nourrice des filles. Alors que Clover et Alex sont enthousiastes, Sam trouve cet amour plus qu'étrange.
23 - Une promotion d'enfer (1)
28 septembre 2005Jerry propose aux filles de devenir agents d'élite du WOOHP. Elles suivent une formation avec un séduisant jeune homme, mais celui-ci est fait prisonnier.
24 - Une promotion d'enfer (2)
5 octobre 2005Les filles sont face à un dilemme : pour sauver Dean, elles doivent éliminer Jerry, mais elles parviennent à le contacter et à élaborer un plan de secours.
25 - Une promotion d'enfer (3)
12 octobre 2005Accompagnées de Jerry, Sam, Clover et Alex se lancent à la poursuite de Terence et de Dean, afin de les empêcher de déclencher le projet «Droïde-Espion».
26 - Le Gourou fou
19 octobre 2005Jerry, qui a adopté un mode de vie basé sur le feng shui, ne porte pas d'intérêt à un tremblement de terre qui a lieu à l'autre bout du monde.