Saison 3 (1998)
1 - La Fin de Jack
17 octobre 1998Le lendemain de l'évasion astucieuse de Jack, après que Samantha ait tenté en vain de le piéger et qu'elle ait tué Sharon par erreur, Samantha doit se tourner vers son passé pour le retrouver. Tout semble converger vers son enfance, révélant que Jack l'a apparemment harcelée toute sa vie. Puis, Jack enlève un nourrisson et tente d'attirer Samantha dans un piège, ce qui permet à la VCTF de découvrir la véritable identité de Jack.
2 - Sombres désirs
24 octobre 1998L'équipe enquête sur un violeur en série devenu meurtrier dans l'Illinois. Le caractère sporadique des attaques, ainsi que le lien entre les victimes retrouvées dans les bois, intriguent Sam. Elle comprend que le tueur est un homme marié, en colère et frustré, qui déverse sa rage sur des femmes sur le point de se marier. Pendant ce temps, Jack étant enfin arrêté et emprisonné, Sam se met en quête d'une nouvelle maison pour elle et Chloé.
3 - Le Sens du devoir
31 octobre 1998Un tueur qui castre ses victimes semble être animé par un sens du devoir civique et de la responsabilité légale. John se retrouve en difficulté sans qu'il y soit pour quelque chose qui paraît dans la presse au sujet de l'affaire.
4 - Vision double
7 novembre 1998Douze habitants d'une petite ville d'Alabama ont mystérieusement disparu. Lorsqu'un des disparus est retrouvé mort, la VCTF ouvre une enquête. Sur place, Sam est déconcertée par les preuves recueillies. Certaines semblent indiquer une pathologie dominante et contrôlante, tandis que d'autres suggèrent une pathologie plus passive et soumise. Sous la pression de Bailey qui souhaite affiner son profil, l'anxiété de Sam grandit et elle commence à douter de ses propres capacités. Plus tard, on découvre que deux tueurs agissent de concert, expliquant ainsi les profils contradictoires. L'un, assoiffé de pouvoir, l'autre, voué à une véritable admiration pour son compagnon, s'est lancé dans une série de meurtres. Soulagée de constater qu'elle possède toujours son intuition, Sam réalise qu'il y a deux tueurs.
5 - Victimes par procuration
14 novembre 1998Des années de violences verbales et physiques ont des conséquences mortelles lorsque la victime se venge de son agresseur. Incapable de tuer la véritable coupable, sa mère, l'homme déséquilibré s'en prend à ceux qui lui rappellent cette femme odieuse. L'équipe enquête et Sam cerne avec justesse la pathologie du tueur, mais suppose à tort qu'il s'en prend à sa femme et non à sa mère. Lorsque l'âge des victimes augmente, Sam réalise son erreur et émet l'hypothèse que le tueur rassemble lentement le courage de tuer sa bourreau. L'équipe se lance alors dans une course contre la montre pour retrouver la femme avant que son fils ne puisse assouvir sa vengeance ultime. En parallèle, Sam comprend qu'elle et Chloé doivent commencer une nouvelle vie et décident, pour ce faire, d'emménager dans une nouvelle maison.
6 - Les Flammes de l'innocence
21 novembre 1998La VCTF est appelée en renfort pour relancer une enquête au point mort. Sam hésite à intervenir, car son ami et ancien amant, Michael Westmore, dirige l'enquête. L'affaire porte sur une série de meurtres où les victimes ont été brûlées vives. Dès le début de l'enquête, Sam et Bailey sont en désaccord sur la façon dont Michael gère l'affaire. Sam estime qu'il faut faire preuve d'indulgence envers son ami, tandis que Bailey juge ses performances insuffisantes et inexcusables.
7 - La Femme idéale
5 décembre 1998Dans la ville natale de George, quelqu'un vole les corps de jeunes femmes juives récemment décédées. George craint qu'il ne s'agisse d'un acte de vandalisme antisémite. Bailey autorise George et Sam à enquêter plus avant sur ce crime plutôt atypique. Sur place, George et Sam découvrent qu'un groupe néonazi est très actif dans la ville.
8 - Coupable ou Victimes
12 décembre 1998Le benjamin d'une famille orpheline tue pour préserver l'unité de ses proches. Le premier meurtre a lieu lorsque le jeune homme assassine le petit ami que sa sœur envisage d'épouser. Ce mariage l'obligerait à quitter sa famille, ce qui est inacceptable. Tout au long de l'épisode, les autres personnes représentant une menace sont rapidement neutralisées. Sam identifie le tueur comme quelqu'un qui a connu la perte et qui tente désespérément de s'accrocher à quelque chose qui lui est cher.
9 - Secret de famille
2 janvier 1999Nourris par les sévices subis durant leur enfance, un frère et une sœur décident de sauver un autre enfant du même sort tragique. Pour ce faire ils assassinent les parents du garçon ainsi que deux de leurs employés. L'équipe d'enquête criminelle (VCTF) est chargée de l'enquête et Sam se lie immédiatement d'amitié avec le garçon maltraité.
10 - Les Dernières Volontés
9 janvier 1999L'un des premiers profils établis par Sam a conduit à la condamnation à mort d'un homme. Dix ans plus tard, alors que son exécution est imminente, une série de meurtres, correspondant au mode opératoire des précédents, se produit. Les analyses balistiques prouvent que la même arme a été utilisée pour tous les crimes. Rongée par la culpabilité d'une erreur potentiellement fatale, Sam rouvre l'enquête.
11 - Double Personnalité
16 janvier 1999Un tueur en série, qui tue à mains nues, abandonne les corps de ses victimes masculines au Brown Derby, au Trocadero et dans d'autres lieux emblématiques d'Hollywood. Sam établit le profil du tueur comme celui d'un homme cherchant à exorciser un traumatisme passé. L'équipe suit une piste qui les mène finalement à un chauffeur de taxi tout à fait ordinaire, qui ne semble pas avoir la force nécessaire pour commettre de tels crimes.
12 - Hérédité
6 février 1999Des personnes apparemment sans lien entre elles sont assassinées dans le sud-est des États-Unis. L'autopsie de Grace révèle que toutes les victimes possèdent le même groupe sanguin rare. Il devient alors évident qu'elles étaient apparentées. L'équipe découvre des preuves confirmant que toutes les victimes étaient les enfants d'un gourou de secte, semblable à Charles Manson, actuellement interné dans un hôpital psychiatrique de Géorgie.
13 - La Tête dans le sac
13 février 1999À South Beach, quartier branché de Floride, un tueur sème la terreur en assassinant de jeunes et beaux individus. Pour couronner le tout, il décapite ses victimes et expose leurs têtes en public. Sam soupçonne le tueur de s'en prendre aux personnes de belle apparence, conséquence d'un manque de confiance en lui.
14 - Le Disciple
20 février 1999Lorsque Donald Lucas, le tueur aux multiples talents emprisonné, parvient à pirater Internet, Bailey craint qu'il ne communique avec un disciple. L'enquête conduit la VCTF à Otis, une petite ville du nord de la Californie en proie à la superstition et à une série de meurtres perpétrés par des personnes aux multiples talents. Avec l'aide du shérif Ed Post, un homme sympathique mais excentrique, Sam, Bailey et leur équipe tentent de retrouver le suspect.
15 - Coup de folie
27 février 1999Une série de meurtres dans le sud-ouest des États-Unis conduit Sam et l'équipe de la VCTF à un couple improbable : Josie Wells, une femme de 32 ans, et Alex Lopez, un garçon de 16 ans, qui l'aurait enlevée sur le terrain de football de son enfant à Boulder, dans le Colorado. Sam découvre que la femme a apparemment été victime de maltraitance durant son enfance et qu'elle a fui sa vie conjugale malheureuse et solitaire pour revivre sa jeunesse avec le garçon rencontré sur une ligne d'écoute téléphonique. Pendant ce temps, Bailey tente de raisonner son ex-femme, Janet, de ne pas se remarier, car il a l'impression qu'elle gâche sa vie.
16 - Le Culte du feu
20 mars 1999Sam et son équipe tentent d'arrêter un pyromane mystique qui sévit à Atlanta. Sam établit son profil : il semblerait qu'il mette lui-même le feu sur place, au péril de sa vie. Après une fausse piste impliquant un photographe toujours présent sur les lieux des incendies, Sam et son équipe découvrent des graffitis en farsi sur les murs des bâtiments incendiés, signifiant « dieu du feu ». L'homme serait à la recherche d'une « élue », immunisée contre le feu, qui l'emmènerait dans l'au-delà retrouver sa défunte épouse. Parallèlement, Sam s'inquiète pour Chloé, qui se replie sur elle-même après qu'un de ses camarades de classe a péri dans un incendie.
17 - Frères ennemis
3 avril 1999Sam et Bailey se retrouvent mêlés à un braquage de bijoux perpétré par trois malfrats déséquilibrés, Randy, Kate et Stevie. La situation dégénère rapidement en prise d'otages dans la bijouterie. Ils s'efforcent d'identifier les auteurs et leurs liens avant que des vies ne soient perdues. Pendant que Sam tente de raisonner Randy, le chef de la bande, pour qu'il se rende, John s'en prend au commandant de police zélé qui, à l'extérieur, veut arrêter ou tuer tous les malfaiteurs, même si cela signifie la mort de tous les otages.
18 - Comme un poisson dans l'eau
10 avril 1999George et Sam infiltrent Borden & Associates, une société de gestion de Palm Beach, en Floride, en se faisant passer pour des agents du fisc. Cinq clients ont été assassinés, mutilés d'un doigt de la main gauche. Alors que Sam dresse le profil du principal suspect, Bobby O'Hara, qui manifeste un intérêt marqué pour elle, le mystérieux chef de la sécurité de la firme, Leo Cantrell, commence à se méfier de la véritable identité de Sam. Parallèlement, Kevin Miller, un agent du FBI arrogant chargé de l'enquête, la complique, au grand dam de Bailey pour la sécurité de Sam, tandis que Miller reste indifférent. De son côté, John collabore avec la lieutenante Cynthia Ford, inspectrice de police locale, pour retrouver les corps.
19 - … Et mat
8 mai 1999Jarod s'apprête à quitter Atlanta mais se ravise quand il entend parler de l'enlèvement d'un jeune garçon. Il rejoint alors la VCTF et rencontre Samantha Waters, profileuse ... Conclusion d'un cross over ayant débuté dans Le Caméléon (Saison 3, épisode 19 : Échec ...)
20 - Névrose
15 mai 1999Sam et Bailey collaborent avec l'agent du FBI Susan Marsh, qui traque Robert Lee Gregg, un notable conservateur d'Atlanta soupçonné du meurtre de six hommes homosexuels. Mais leur enquête est perturbée par Richard Russell, l'ex-petit ami de Susan, qui la harcèle. Susan affirme maîtriser la situation, mais Bailey en doute lorsque son petit ami est retrouvé assassiné et que Russell devient suspect. La situation s'aggrave lorsque Russell prend pour cible Bailey et son ex-femme Janet, qui sont désormais de nouveau ensemble. Pendant ce temps, Sam quitte l'enquête et se rend à Miami pour enquêter sur la disparition d'un homme qui pourrait être lié aux meurtres de Gregg. Elle se retrouve alors courtisée par Mario Monagno (de l'épisode « Pile ou face »), qui souhaite toujours la revoir.
21 - Le Vrai Visage de Jack (1)
5 juin 1999Le procès de Donald Lucas débute alors que l'équipe se rend au Mexique, dans la petite ville de Las Brisas. Depuis un an, des femmes disparaissent sans laisser de traces et des corps ont été découverts. Leur enquête est cependant entravée des deux côtés de la frontière par le chef de police corrompu, Miguel Villalobos, sous la coupe du shérif américain J.D. Tollman. Ce dernier tente de faire dérailler l'enquête de la VCTF lorsque les meurtres mènent à un puissant homme d'affaires américain, James Lofton, propriétaire d'une usine textile à Las Brisas et fréquentant des prostituées locales, dont certaines ont été victimes. Tout en assistant Marta Fernandez, une policière loyale, Sam et son équipe font régulièrement l'aller-retour à Atlanta pour le procès de Lucas. Ils assistent notamment Marta Fernandez, Bailey et George, qui témoignent contre lui. Le shérif Ed Post d'Otis, en Californie, témoigne également en faveur de Sam.
22 - Le Vrai Visage de Jack (2)
5 juin 1999Le procès de Donald Lucas débute alors que l'équipe se rend au Mexique, dans la petite ville de Las Brisas. Depuis un an, des femmes disparaissent sans laisser de traces et des corps ont été découverts. Leur enquête est cependant entravée des deux côtés de la frontière par le chef de police corrompu, Miguel Villalobos, sous la coupe du shérif américain J.D. Tollman. Ce dernier tente de faire dérailler l'enquête de la VCTF lorsque les meurtres mènent à un puissant homme d'affaires américain, James Lofton, propriétaire d'une usine textile à Las Brisas et fréquentant des prostituées locales, dont certaines ont été victimes. Tout en assistant Marta Fernandez, une policière loyale, Sam et son équipe font régulièrement l'aller-retour à Atlanta pour le procès de Lucas. Ils assistent notamment Marta Fernandez, Bailey et George, qui témoignent contre lui. Le shérif Ed Post d'Otis, en Californie, témoigne également en faveur de Sam.