Saison 3 (2006)
1 - Jungle urbaine
9 octobre 2006Danny doit affronter un nouveau fantôme très puissant : Le Roi des végétaux, un fantôme qui peut se régénérer et produire des grosses masses de plantes sauvages. En plus, il est tellement fort que Danny n'arrive pas à le vaincre. Mais grâce à Glace Pilé, Danny pourra développer son nouveau pouvoir de fantôme. La Cryogénie, un pouvoir permettant de jaillir de la glace et des boules de neige et c'est avec ce pouvoir que Danny est de classe 10/10 et le rend aussi puissant que les autres fantômes auxquels il a eu affaire. Mais ce pouvoir sera-t-il suffisant pour que Danny réussit à sauver Amity Park du monstre végétal ?
2 - Royaumes infinis
9 juillet 2007Danny aide à tirer une épine de la du derrière de Glace Pilé. Une créature polaire semblable à l'abominable homme des neiges qui vit dans le secteur le plus froid du Royaume des Fantômes. Et pour lui montrer sa gratitude, il lui confie l'infi-carte, pouvant mener son utilisateur dans toutes les issues du Royaume des Fantômes. Mais Vlad Plasmius a concocté un plan pour s'emparer de la carte.
3 - Le Pouvoir aux femmes
10 juillet 2007Après une dispute avec leurs petits amis respectifs, Spectra, Kitty et Ember s'allient et utilisent leurs pouvoirs pour faire disparaître tous les hommes. Danny et Jack pêchent dans le lac Érié, le seul endroit sur Terre immunisé contre le sort. Sam, Jazz et Maddie doivent arrêter les méchantes pendant que Danny est hors de la ville. Malheureusement pour Danny, Skulker passe plus de temps à le traquer afin de prouver à sa petite amie qu'il est un excellent chasseur. Amity Park pourra-t-il être sauvé sans son héros ?
4 - Des torrents de terreur
11 juillet 2007Vlad libère accidentellement Vortex, un puissant fantôme qui contrôle la météo comme la pluie et le beau temps. Danny a subi une partie des pouvoirs de Vortex. Vlad lui demande de l'aide pour vaincre Vortex, mais il tellement puissant qu'il répand un climat catastrophique sur le monde entier. Danny pourra-t-il arrêter tous ces désastres avant qu'il ne soit trop tard ?
5 - Fantôme pour toujours
12 juillet 2007Un nouveau fantôme est arrivé à Amity Park : Amorpho, un fantôme qui peut prendre la forme de n'importe qui et commence à embêter Danny Fantôme et Danny commence à perdre soudainement et mystérieusement ses pouvoirs. Amorpho pourra-t-il quitter les lieux ?
6 - Les Fenton s'enrichissent
13 juillet 2007Les Fenton vendent Fenton Works aux Guys in White qui prévoient de détruire la Zone Fantôme (sans savoir que la Terre sera également détruite) à l'aide d'un missile. Pendant ce temps, Danny commence à se laisser séduire par la vie luxueuse et met en péril son amitié avec Sam et Tucker. Johnny 13 et Youngblood sont en réalité gentils avec Danny dans la Zone Fantôme.
7 - Œil pour œil
20 août 2007Vlad Masters pour sa candidature pour maire d'Amity Park en rejetant le premier maire. Danny doit empêcher les nouvelles lois d'être appliquées par le nouveau maire : Le Nasty Burger a été démoli afin de créer un nouveau restaurant le "Mc Masters", les appareils de Tucker ont été confisqués, un nouveau code vestimentaire a été appliqué, la surveillance et la sécurité fut chargée par des policiers impitoyables et Les Hommes en Blanc remplacent Danny pour chasser les fantômes. Un problème : Vlad avait de multiples raisons de convaincre la ville que Danny était un mauvais fantôme. Aidé de ses meilleurs amis, Danny doit être plus futé que Vlad et s'il réussit, le maire Vlad peut ruiner sa carrière.
8 - La Boîte de Pandore
21 août 2007Comme on sait que le fantôme des cartons est un fantôme très facile à battre, il repart une 9e fois pour le Royaume des Fantômes, espérant de trouver une boîte vraiment terrifiante. La boîte de Pandore, la légende dit que cette boîte renferme les pires malveillances de l'univers juste dans une petite boîte légère. En se promenant sur l'île de Skulker, il le prend pour un inconscient. Il retourne à Amity Park pour y semer la terreur avec pleines de choses horribles. Danny pourra- t-il ramener Pandore avant qu'il soit trop tard.
9 - Cauchemars
22 août 2007Nocturne est un fantôme des rêves qui contrôle tous les rêves. Après son dernier combat avec Danny Fantôme, il parcourt le reste de la ville même Vlad Masters n'a rien pu faire pour se défendre. Pour vaincre Nocturne une bonne fois pour toutes bien qu'il soit affaibli, Danny doit entrer dans son rêve. Pour cela, il doit avoir l'aide de Sam, Jazz et Tucker.
10 - La Colonie hantée
23 août 2007La classe de Danny part en camping avec M. Lancer et Mme Teslaff dans un endroit abandonné qui semble hanté. Très vite, des témoignages faisant état d'apparitions de monstres et de disparitions d'élèves sèment la panique dans tout le camp. Des monstres commencent à apparaître et à perturber le séjour. À la grande surprise de Danny, ces monstres sont des fantômes travaillant pour Walker, à la recherche de Wulf. Danny doit désormais sauver son vieil ami et sa classe des griffes de Walker !
11 - Opération sauvetage
24 août 2007Dannie Fantôme est de retour à Amity Park, mais Vlad court toujours et est prêt à tout pour la reprendre sa fille bien-aimée. Pour cela, il appelle Valérie pour lui font confier une mission. Croyant qu'elle doit éliminer Danny Fantôme, Vlad lui dit que Dannie Fantôme est un fantôme très dangereux qui ne fait que s'attaquer à lui. Danny pourra-t-il résonner Valérie pour la dire que Vlad lui a menti ?
12 - La Planète fantôme
24 août 2007Danny renonce à ses pouvoirs après qu'une équipe de chasseurs de fantômes formée par Vlad l'ait rendu inutile. Mais l'équipe finit par faire payer ses services, et Vlad exige d'être nommé souverain de la Terre en échange de avoir sauvé la planète d'un astéroïde errant.