Saison 4 (1998)
1 - Lavage de cerveau - Partie 1
14 septembre 1998Minus et Cortex sont kidnappés à Washington, DC par une force inconnue. Cortex perd la mémoire et les souris sont alors emprisonnées dans une ville où tout le monde est obligé d'exécuter le Schëerskåhøvên, qui abrutit tout le pays.
2 - Lavage de cerveau - Partie 2
15 septembre 1998Cortex retrouve la mémoire et les souris s'échappent. Ils pensent que Snowball est responsable du Schmëerskåhøvên, mais le trouvent emprisonné dans un établissement psychiatrique.
3 - Lavage de cerveau - Partie 3
16 septembre 1998Les souris et Snowball recherchent celui qui a épissé leur ADN, le Dr Mordough, pensant qu'il est responsable de tout cela. Mais il s'avère que c'est son chat, Precious, et le temps presse.
4 - Vers la Russie
21 septembre 1998Le projet de Minus et Cortex de modifier le caviar avec une capsule mutante est compliqué par une souris de laboratoire russe.
5 - Pendule de coucou
21 septembre 1998Cortex complote pour que chaque horloge sur Terre sonne à plusieurs reprises.
6 - Réunion spéciale
21 septembre 1998Une émission spéciale sur les moments forts de leur carrière est diffusée, mais tout cela n'est en réalité qu'une ruse pour que Minus et Cortex puissent hypnotiser les téléspectateurs.
7 - La légende de la queue
28 septembre 1998Inspiré par les légendes du passé, Cortex tente de créer une légende sur lui-même pour acquérir une renommée mondiale.
8 - Projet B.R.A.I.N.
28 septembre 1998Comment Acme Labs est devenu le foyer de Minus et Cortex.
9 - Star Warners
4 novembre 1998Dans la finale de la série Minus et Cortex, Cortex et les personnages d'Animaniacs développent une parodie de Star Wars.