Saison 3 (1997)
1 - Castomania
8 septembre 1997Cortex fait appel aux castors pour contrôler le cours des rivières.
2 - Nouvelle vague
8 septembre 1997Les souris tournent une série de films comiques et atteignent le succès.
3 - Minus cortex et..Larry
13 septembre 1997Minus et Cortex ont un nouveau compagnon, Larry, mais leur nouveau plan ne semble pas fonctionner.
4 - Sauvez les souritilopes
13 septembre 1997Dans leur dernier plan, Minus et Cortex tentent de prendre le contrôle des aciéries de Pittsburgh, en Pennsylvanie, en se faisant passer pour des membres d'une espèce en voie de disparition, les Mousealopes.
5 - Série noire
13 septembre 1997Nous sommes en 1946 et le nouveau plan de Brain est interrompu lorsque Minus et lui rencontrent Billie et Snowball.
6 - La guerre du golf
15 septembre 1997Cortex se met en tête de gagner un tournoi de golf, même si cela interfère avec son nouveau plan.
7 - Monsieur le monde
15 septembre 1997Après que la Terre a obtenu le pouvoir de la parole grâce à son appareil Silitronlinguifactor, Cortex élabore un nouveau plan.
8 - Le voisin
16 septembre 1997Cortex tente de récupérer un colis qui lui est destiné auprès de son voisin.
9 - Guibolsmania
17 septembre 1997Minus devient gourou dans les années 1960.
10 - Minus a une idée
17 septembre 1997C'est l'anniversaire de Minus et Cortex organise une fête surprise.
11 - Les vieux d'la vieille
18 septembre 1997Après avoir eu un aperçu de son avenir, Cortex abandonne ses tentatives de conquête du monde et se fait embaucher comme moniteur de ski.
12 - Tempête sous un crâne
19 septembre 1997Les souris cherchent à lutter contre les tornades, mais un parasite se met en travers de leur chemin.
13 - Un peu d'histoire
20 septembre 1997Cortex chante les échecs des dirigeants mondiaux passés et présents.
14 - Farces et attrapes
20 septembre 1997Les souris doivent pénétrer dans une mine, mais doivent faire semblant de rejoindre une société de type amish.
15 - Le protocole Minus
22 septembre 1997Le dernier plan de Cortex est une théorie du complot sur les raisons pour lesquelles il ne règne pas sur le monde.
16 - Quand les souris dansent
26 septembre 1997Cortex devient un danseur de claquettes avec des jambes à vapeur afin de diffuser un code morse subliminal lors de l'exposition universelle.
17 - Casting
26 septembre 1997Cortex est à court d'idées pour conquérir le monde, alors il essaie d'en trouver auprès d'écrivains.
18 - Les arpents de Cortex
27 septembre 1997Le fermier Cortex tente de faire pousser une armée de légumes monstrueux.
19 - L'apprenti sorcier
29 septembre 1997Cortex crée une machine à cloner et projette de se cloner lui-même afin de créer la meilleure troupe de danse celtique que le monde ait jamais vue.
20 - Calvin crane
29 septembre 1997Cortex se fait passer pour un créateur de mode.
21 - Minous souavo
4 octobre 1997Cortex prévoit d'utiliser le Personalitron pour lui donner un charisme irrésistible, mais c'est Minus qui en bénéficie.
22 - H.T.O.
4 octobre 1997Les souris apprennent l'existence d'une organisation secrète, H.T.O. (composée de dirigeants mondiaux), et tentent d'y entrer.
23 - La vraie vie
10 octobre 1997Une maison nécessaire au dernier complot de Cortex devient le décor d'une série de télé-réalité sur les personnes qui y vivent. Les souris deviennent donc des participants pour y entrer.
24 - Cortexnatra
11 octobre 1997Pour sauver son casino de Las Vegas, Cortex travaille comme chanteur de salon.
25 - Halloween
19 octobre 1997M. Itch propose à Cortex de contrôler le monde en échange de son âme, mais Cortex refuse. Dans un revirement choquant, Minus vend son âme pour que cela se produise et Cortex décide bientôt de récupérer son ami.
26 - La légende de Big Cortex
2 novembre 1997Cortex prend l'identité de Briany Jack, un leader hippie, et tente de créer une chaîne de la paix pour envoyer un message subliminal.
27 - Mon ego
7 novembre 1997La tentative de Cortex de contrôler l'empereur François-Joseph dérape lorsqu'il évoque ses problèmes avec le psychiatre Sigmund Freud.
28 - Star au Japon
7 novembre 1997Cortex entre dans le monde d'un combat de sumo pour acquérir un poisson paralysant.
29 - Mais ce n'est pas tout
8 novembre 1997Cortex prend le contrôle d'un satellite pour diffuser son infopublicité dans le monde entier, mais le satellite appartient à l'armée et celle-ci veut capturer celui qui a piraté ses systèmes.
30 - Opération lion de mer
14 novembre 1997Cortex prend le contrôle des mammifères aquatiques pour son dernier plan et Minus tombe amoureux d'une femelle otarie.
31 - La caverne
14 novembre 1997Cortex tente de modifier les conditions météorologiques de la Terre.
32 - Le tailleur et les souris
15 novembre 1997Un tailleur bien intentionné rend la vie de Minus et Cortex misérable.
33 - La vie sauvage
15 novembre 1997Dans un camp de vacances pour les enfants des dirigeants mondiaux, Cortex tente de piéger les enfants en plaçant des dispositifs d'écoute dans les bureaux de leurs parents.
34 - Au bâton
22 novembre 1997Pour libérer le répulsif pour cuir de Cortex, les souris deviennent des joueurs de base-ball.
35 - Spiel-borg 2000
22 novembre 1997Le dernier plan de Cortex pour dominer le monde est le Schpiel-Borg 2000, qui accueille une rétrospective des épisodes précédents.
36 - Comédie musicale à Broadway
3 janvier 1998Minus et Cortex mettent en scène leurs propres comédies musicales, qui connaissent un succès variable.
37 - Cortex de Winnie
7 février 1998Parodiant Winnie l'ourson, Minus et Cortex tentent de voler le miel d'une ruche.
38 - Cortex mélancolique
7 février 1998Cortex tente de semer le chaos dans la famille d'Hamlet et d'en prendre le contrôle.
39 - L'héritage de la toux
14 février 1998Cortex tente de devenir un héros national en s'attaquant à une compagnie de tabac.
40 - Soirée de repos
21 février 1998Pendant la nuit, Minus et Cortex essaient d'autres choses que de s'emparer du monde.
41 - Plage et coquillages
21 février 1998Cortex tente d'inciter les surfeurs à appliquer sa lotion solaire, Cortex de Soleil, qui crée un effet hypnotique.
42 - La famille Narf
21 février 1998Cortex inscrit la famille de Minus à un concours pour gagner 25 000 dollars.
43 - Le tour de Minus
28 février 1998Minus a son propre plan pour dominer le monde et Cortex l'accompagne.
44 - Le réchauffement climatique
28 février 1998Cortex explique pourquoi il devrait être chef dans un faux film éducatif.
45 - Les granules
25 avril 1998Comme les dirigeants de la chaîne ne cessent de modifier leur émission, Minus et Cortex décident d'arrêter.
46 - Cerveaux dangereux
2 mai 1998Alors qu'il prépare son plan de domination du monde, Cortex se met à enseigner à des élèves rebelles.
47 - Bébé Cortex
9 mai 1998Minus et Cortex se font passer respectivement pour une mère et un enfant stars afin d'obtenir l'argent nécessaire au plan suivant.
48 - Dites juste Narf
9 mai 1998Minus chante une chanson sur le fait de dire "narf".
49 - Point de vue de Minus
16 mai 1998C'est encore une nuit habituelle où Cortex projette de conquérir le monde, mais du point de vue de Minus.
50 - Le grand dictateur
16 mai 1998Les souris chantent la domination du monde.
51 - Nourriture du cerveau
16 mai 1998Cortex ouvre un restaurant et donne aux clients une drogue qui les rend plus intelligents.