Saison 2 (1996)
1 - Papier gâché
7 septembre 1996Minus et Cortex attirent l'humanité sur un monde de substitution fabriqué en papier mâché. Grâce à cette astuce, ils veulent enfin régner sur la vraie Terre. Mais ils trouvent finalement assez ennuyeux de gouverner une Terre déserte.
2 - Curieuses impressions
14 septembre 1996Grâce à la presse à imprimer de Johannes Gutenberg, Cortex fabrique une série de cartes à collectionner.
3 - La tête de l'art
14 septembre 1996Un artiste moderne à succès est né et c'est Minus, qui essaie d'aider à financer le nouveau projet de Brain.
4 - Rencontre avec un drôle de type
28 septembre 1996Cortex espère que son correspondant intergalactique, Zalgar, l'aidera à conquérir le monde. Mais il s'avère que Zalgar aime manger des cerveaux.
5 - Votez Minus
2 novembre 1996Minus écrit une lettre au journal pour critiquer la bande dessinée "The Family Circus". Sa lettre est cependant prise pour une déclaration politique, ce qui le propulse sous les feux de la rampe et le conduit à la présidence des États-Unis. L'administration de Minus doit cependant faire face à un scandale lorsque les plans de Cortex pour conquérir le monde sont rendus publics.
6 - Cortex Song
9 novembre 1996Cortex réalise un film larmoyant pour rendre le monde suffisamment triste pour qu'il devienne chef.
7 - L'appel de la jungle
16 novembre 1996Les défenseurs des droits des animaux pensent que Minus et Cortex sont des singes et les relâchent dans la jungle après les avoir fait sortir des laboratoires Acme. Ils tentent de rentrer chez eux, mais tombent sur le vieil ennemi de Cortex, Boule de Neige.
8 - Bien dégagé derrière les oreilles
23 novembre 1996Cortex tente de découvrir ce qui rend le légendaire Sampson si fort.
9 - Mégalos anonymes
23 novembre 1996Lorsque Cortex arrive à la conclusion qu'il ne veut plus dominer le monde, il décide d'aider d'autres personnes qui ont eu le même problème que lui et la première à être aidée est Minus.
10 - Cortex des bois
28 décembre 1996Minus et Cortex sont enfermés dans une pyramide égyptienne où rôde une momie.
11 - La momie
28 décembre 1996Cortex demande à un groupe d'hommes de voler l'argent des riches (comme Robin des Bois) pour financer son nouveau projet.
12 - Deux souris et un couffin
1 février 1997Minus et Cortex tombent sur un bébé superpuissant qui arrive d'un monde extraterrestre en pleine explosion.
13 - Le labyrinthe
1 février 1997Minus et Cortex doivent braver un labyrinthe de réalité virtuelle pour trouver une puce électronique cruciale pour le nouveau complot de Cortex.
14 - Futur antérieur
8 février 1997Les futurs des souris arrivent au laboratoire et les entraînent dans un tour de montagnes russes à travers le temps pour trouver un kit de domination du monde.
15 - Minex
22 février 1997L'ADN de Minus et de Cortex fusionne lors d'une expérience de clonage, créant ainsi une nouvelle souris.
16 - Cortex joue et perd
17 mai 1997Minus et Cortex mettent sur pied une équipe de basket-ball dans le cadre de leur prochain plan, mais la célébrité risque d'enfler la tête de Cortex.