Saison 1 (2003)
Martin Mystère est un jeune adolescent de 16 ans, employé en tant qu'agent spécial au « Centre », une organisation secrète spécialisée dans les phénomènes paranormaux dirigé par M.O.M. Souvent dragueur lors des missions qui lui sont attribuées, il enquête, en compagnie de sa demi-sœur Diana Lombard, de Java des Cavernes et avec l'aide, aussi, de sa montre-gadget Chrono-Scan, dans des endroits très étranges, mystérieux et effrayants où se trouvent des créatures inimaginables.
1 - La Créature du Marais
23 octobre 2003Un monstre s'en prend aux enfants désobéissants.
2 - L'essaim contre-attaque
24 octobre 2003Des insectes préhistoriques sont ramenés à la vie par une météorite.
3 - Le cri venu d'ailleurs
27 octobre 2003Une sirène mi-femme, mi-oiseau, enchante les marins d'un port de Norvège.
4 - Le slime est vivant
28 octobre 2003Une créature faite de pétrole téléportant ses victimes et les privant de leur énergie vitale.
5 - La Malédiction des Abysses
30 octobre 2003Un Léviathan saccage le port de Monaco.
6 - Le Cercle de l'Effroi
31 octobre 2003Une sorcière revient de son exil et change les élèves d'un pensionnat en sorcières à leur tour.
7 - La Marque de Mimésis
3 décembre 2003Un loup-garou s'en prenant aux promoteurs immobiliers travaillant sur un territoire indien.
8 - Enlevés dans l'Autre Dimension
10 décembre 2003Un portail spatio-temporel transporte les passagers d'un métro dans une dimension où règne un dragon.
9 - La Créature du Chaos
17 décembre 2003Une créature amenant le Chaos, solide, liquide et gazeuse.
10 - L'Attaque du Marchand de Sable
20 décembre 2003Le marchand de sable emmène ses victimes dans leurs pires cauchemars.
11 - Un Noël éternel
1 janvier 2004M.O.M. envoie Martin et Diana en mission mais ils ont disparu. Un homme à la recherche d'un Noël éternel a cassé un globe neigeux magique et s'ils n'arrivent pas à réparer cela, Martin et Diana risquent de rester prisonniers...
12 - Le Réveil du Druide Noir
7 janvier 2004Un druide change les gens en arbres afin de renaître.
13 - Ils viennent des profondeurs !
7 février 2004Des extraterrestres enfouis sous les lignes Nazca au Pérou tente de redécoller.
14 - L'Antre des Esprits Frappeurs
8 février 2004Un fantôme de directeur d'hôtel en chasse ses occupants.
15 - La Créature de la Grotte Mystérieuse
9 février 2004Un docteur hypnotise Java afin de trouver un trésor gardé par un esprit.
16 - La Frayeur des Neiges
1 mars 2004Un monstre congelant les humains s'aventurant dans son territoire montagneux.
17 - Le monstre vient de l'intérieur
2 mars 2004Un monstre s'échappe du centre en prenant contrôle de l'humain s'approchant de lui.
18 - Le Bijou Maudit d'Halloween
29 mars 2004Un ancien dieu celtique prévoit d'envahir le monde à Halloween.
19 - La Revanche du Banni
31 mars 2004Un dopplegänger efface le visage des femmes ressemblant à celle qui la fuie.
20 - Le Retour des Monstres Gluants
1 avril 2004Dans un flash-back, à New York, des monstres préhistoriques gluants (Java est le premier) apparaissent.
21 - L'Homme Mite attaque
2 avril 2004Martin, Diana et Java enquêtent sur la disparition d'un étudiant à l'université de Paris. Ils découvrent que l'école s'est servie de l'étudiant comme cobaye et l'a transformé en mite humaine, dévorant quiconque entre en contact avec elle...
22 - Le Cauchemar de l’Été
30 avril 2004Un lézard extraterrestre, Sauros, tente de quitter la Terre en terrorisant les habitants de la colonie voisine.
23 - La Vengeance du Mutant
3 mai 2004Un homme transformé en rat s'en prend à ceux qui l'on involontairement créé.
24 - Hurlements dans la forêt
4 mai 2004Martin et Diana rejoignent le père de Martin pour passer un week-end dans les bois. Ils découvrent un 'Synth', créature synthétique entre humain et extraterrestre, décidé à récupérer son territoire envahi par les bûcherons...
25 - Le brouillard de l'effroi
4 juin 2004Martin, Diana et Java partent enquêter sur les rives de l'Amazone, où des plantes et des animaux s'échouent. Suite à des travaux, un étrange nuage a fait son apparition. Il est formé de Vapeur, une bactérie très ancienne...
26 - L'Armée des Ténèbres
7 juin 2004Un sorcier chinois veut faire revivre l'empereur en donnant vie aux statues.