Dans la ville de Neo Kyoto, le statut social d'une personne est déterminé par son habileté à un jeu de cartes appelé Build Divide. L'intrigue suit Teruto Kurabe qui, avec l'aide d'une mystérieuse jeune fille nommée Sakura Banka, se lance dans la bataille « Rebuild » afin d'obtenir une « clé » qui lui permettra de défier le roi. La rumeur veut que vaincre le roi permette de réaliser n'importe quel souhait, ce qui est l'objectif de Teruto.

L'histoire se déroule trois ans après les événements de la première saison et suit une Neo Kyoto transformée et en ruines. Les serviteurs du roi, KUGE, volent les pouvoirs magiques des citoyens, et Kikka, autrefois puissante, est désormais en fuite et tente de survivre sans son deck Build-Divide. La saison se concentre sur les conséquences de la conclusion de la série originale, avec une nouvelle histoire qui se déroule dans la ville en ruines et le retour du nouvel antagoniste, Mario Higuma, qui sème encore plus la destruction.