Saison 4 (2000)
1 - L'Affaire du Beronga
16 septembre 2000Les MIB pourchassent un Beronga, un alien dévorant l'acier et buvant l'eau de tout Manhattan...
2 - L'Affaire des gladiateurs
23 septembre 2000Les Worms se volatilisent au milieu d'une conversation avec J. K et J découvrent qu'ils ont été téléportés à des années-lumière de la planète...
3 - L'Affaire de l'enlèvement du prince
30 septembre 2000J se fait passer pour un étudiant afin de protéger un prince extraterrestre menacé par des terroristes.
4 - L'Affaire de l'or noir
7 octobre 2000Les MIB sont sur la piste d'un réseau criminel ciblant des sites d'exploitations pétrolières...
5 - L'Affaire du pouvoir des Worms
21 octobre 2000J est projeté dans le futur. K met tout en œuvre pour le retrouver, le problème majeur étant de savoir dans quelle époque J a été envoyé...
6 - L'Affaire du globe de Thazian
14 avril 2001L'équipe des MIB tente de sauver les habitants de Thazian, une planète de la taille d'une balle de baseball...
7 - L'Affaire de la sauce pimentée
21 avril 2001Jay se délecte ne nourriture extraterrestre épicée au cours d'une soirée. Il se transforme aussitôt en torche humaine...
8 - L'Affaire du cirque de l'univers
28 avril 2001J protège Zobo, un extraterrestre qui a témoigné contre de grands criminels aliens. Ils se cachent dans un cirque...
9 - L'Affaire de la machine d'entraînement
5 mai 2001K et J s'entraînent sur un simulateur de combat. J, mécontent de ses résultats, recommence son exercice mais cette fois-ci, les aliens tirent avec de vraies armes...
10 - L'Affaire du reportage sur le MIB
12 mai 2001Le MIB est envahi par une équipe de télévision. Le directeur leur permet de faire un portrait de l'agent K...
11 - L'Affaire du super-héros
26 mai 2001Harry Dribble, un extraterrestre, en a assez de jouer les petits travailleurs . Il décide de devenir le super-héros de New York...
12 - L'Affaire de l'invasion (1)
23 juin 2001Les MIB connaissent une crise sans précédent : des forces armées extraterrestres envisagent d'envahir la Terre. L'ONU et la Maison blanche sont attaqués...
13 - L'Affaire de l'invasion (2)
30 juin 2001La Terre est sur le point d'être envahie par les extraterrestres. La situation semble désespérée. Z déclenche le code 14, c'est-à-dire l'évacuation...